[1]郑婷婷 毛军军 吴涛 程家兴.Profile覆盖算法在蛋白质二级结构预测中的应用[J].计算机技术与发展,2007,(09):171-173.
　ZHENG Ting-ting,MAO Jun-jun,WU Tao,et al.Application of Profile Covering Method in Protein Secondary Structure Prediction[J].,2007,(09):171-173.
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Profile覆盖算法在蛋白质二级结构预测中的应用()
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《计算机技术与发展》[ISSN:1006-6977/CN:61-1281/TN]

卷:
期数:
2007年09期
页码:
171-173
栏目:
应用开发研究
出版日期:
1900-01-01

文章信息/Info

Title:
Application of Profile Covering Method in Protein Secondary Structure Prediction
文章编号:
1673-629X（2007）09-0171-03
作者:
郑婷婷1; 2 毛军军1; 2 吴涛1; 2 程家兴2
[1]安徽大学数学与计算科学学院[2]安徽大学计算智能与信号处理教育部重点实验室
Author(s):
ZHENG Ting-ting;  MAO Jun-jun;  WU Tao;  CHENG Jia-xing
[1]School of Mathematics and Computational Science, Anhui Univ[2]Ministry of Education Key Lab. of Intelligent Computing ＆ Signal Processing, Anhui Univ
关键词:
氨基酸序列; 蛋白质二级结构; 覆盖算法; Profile编码
Keywords:
amino acid sequences;  protein secondary structure; coveting algorithm;  Profile encoding
分类号:
TP18
文献标志码:
A
摘要:
介绍了构造性机器学习方法——覆盖算法在蛋白质二级结构预测中的应用。相比普通的神经网络，这种方法直观且运算简单，对训练样本可100％识别。同时，考虑到同源家族的结构应该比单条序列结构预测更准确，采用了基于概率的Profile编码方式，相比以往的预测方法，具有更好的稳定性和精确性
Abstract:
Mainly introduces protein secondary structure prediction based on structural machine learning-covering algorithm. Compared with common neural network, this approach is more easily understood and simpler, and its identification can get to 100%. At the same time, considering accuracy rate of homologous family structure prediction should be higher than of single sequence structure prediction, use Profile encoding, compared with obvious ways, which has better stability and higher accuracy rate

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备注/Memo

备注/Memo:
国家自然科学基金（60475017）;安徽省自然科学基金（050420208）;安徽省高校省级自然科学研究基金（2006KJ244B）;安徽大学人才队伍建设基金郑婷婷（1978-），女，安徽合肥人，讲师，博士研究生，研究方向为智能计算、神经网络理论与应用、生物信息分析；程家兴，教授，研究方向为智能计算、算法分析与设计、最优化方法
更新日期/Last Update: 1900-01-01